Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX27Q96L92 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms