Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NSL1Q96IY1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSL1Q96IY1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms