Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APIPQ96GX9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APIPQ96GX9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms