Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP6Q96FZ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms