Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms