Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDC3Q96F86 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDC3Q96F86 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDC3Q96F86 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EDC3Q96F86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EDC3Q96F86 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDC3Q96F86 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC3Q96F86 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC3Q96F86 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC3Q96F86 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC3Q96F86 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDC3Q96F86 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EDC3Q96F86 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EDC3Q96F86 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EDC3Q96F86 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms