Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms