Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC11Q96DB2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC11Q96DB2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms