Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIFAQ96CG3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIFAQ96CG3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms