Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RUNDC1Q96C34 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms