Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms