Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB1CQ92928 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB1CQ92928 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms