Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDAQ92838 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDAQ92838 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDAQ92838 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDAQ92838 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDAQ92838 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDAQ92838 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDAQ92838 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDAQ92838 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDAQ92838 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDAQ92838 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDAQ92838 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDAQ92838 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EDAQ92838 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDAQ92838 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDAQ92838 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDAQ92838 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
EDAQ92838 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDAQ92838 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDAQ92838 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDAQ92838 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms