Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT35Q92764 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT35Q92764 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms