Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3AQ92664 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3AQ92664 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms