Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC107Q8WV48 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms