Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM4Q8NFZ8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CADM4Q8NFZ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms