Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1CQ8NER5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms