Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RDH13Q8NBN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH13Q8NBN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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