Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM87AQ8NBN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM87AQ8NBN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms