Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC185Q8N715 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC185Q8N715 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms