Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP4Q8N3C7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CLIP4Q8N3C7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CLIP4Q8N3C7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CLIP4Q8N3C7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CLIP4Q8N3C7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CLIP4Q8N3C7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIP4Q8N3C7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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