Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC43Q8N309 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC43Q8N309 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms