Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EID3Q8N140 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EID3Q8N140 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms