Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM48Q8IWZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms