Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS2ST1Q7LGA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms