Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6AQ7L8S5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTUD6AQ7L8S5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6AQ7L8S5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms