Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM44Q6ZP01 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM44Q6ZP01 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM44Q6ZP01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM44Q6ZP01 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms