Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms