Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM20Q6UY09 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms