Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMBR1LQ6UX01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms