Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHC4Q6S5L8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHC4Q6S5L8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC4Q6S5L8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms