Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA5Q6Q788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOA5Q6Q788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms