Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF7Q6Q0C0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms