Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM2L1Q6PCE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM2L1Q6PCE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGM2L1Q6PCE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM2L1Q6PCE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM2L1Q6PCE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms