Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN1Q6NZI2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAVIN1Q6NZI2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN1Q6NZI2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms