Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KANK3Q6NY19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KANK3Q6NY19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KANK3Q6NY19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms