Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALKBH2Q6NS38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALKBH2Q6NS38 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms