Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT79Q5XKE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms