Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHIC1Q5VXU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CHIC1Q5VXU3 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHIC1Q5VXU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms