Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA1Q5VX52 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms