Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRCH2Q5VUJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH2Q5VUJ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms