Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RSPH4AQ5TD94 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RSPH4AQ5TD94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH4AQ5TD94 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms