Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9C2Q5TAH2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9C2Q5TAH2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC9C2Q5TAH2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms