Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00242Q5T6M2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms