Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERM1Q5SV97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PERM1Q5SV97 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms