Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX1Q5SQQ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms