Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC178Q5BJE1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC178Q5BJE1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms