Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPAT3Q53EU6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms