Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms